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學(xué)術(shù)交流

中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)張增輝教授、中南大學(xué)曹東升教授、上海交通大學(xué)陳海峰教授做客我?!扒把乜茖W(xué)報告”

2022-05-10 17:46 文、圖/化工學(xué)院 陳香李 點(diǎn)擊:[]

5月9日,應我??萍继?、前沿院及化學(xué)與化工學(xué)院邀請,中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)張增輝教授、中南大學(xué)曹東升教授和上海交通大學(xué)陳海峰教授做客我?!扒把乜茖W(xué)報告”,作了題為“蛋白質(zhì)相互作用的理論計算方法與應用”“人工智能藥物設計方法與應用研究”和“無(wú)規蛋白環(huán)境特異的精準分子力場(chǎng)研究及應用”的報告。報告會(huì )由化學(xué)與化工學(xué)院副院長(cháng)仝建波主持,學(xué)院相關(guān)專(zhuān)業(yè)教師、研究生聆聽(tīng)了此次報告會(huì )。

張增輝教授介紹了課題組在計算預測蛋白—配體和蛋白—蛋白相互作用的結合自由能及其蛋白變異對結合自由能的定量影響的計算方法的研究。這些方法的應用為認識和設計蛋白—配體及蛋白—蛋白相互作用提供了重要和精確定量的原子層面的信息,其理論計算和預測的精度在不斷趨近于實(shí)驗誤差范圍,這些自由能理論計算方法的不斷發(fā)展和應用將對藥物設計,抗體設計和蛋白設計提供具有實(shí)際意義的理論計算指導。

曹東升教授從創(chuàng )新藥物發(fā)現亟待變革性新模式的背景出發(fā),介紹了課題組運用各種人工智能技術(shù)、機器學(xué)習方法、分子模擬、計算化學(xué)、化學(xué)信息學(xué)以及生物信息學(xué)技術(shù)來(lái)實(shí)現自動(dòng)的問(wèn)題假設生成,活性預測和實(shí)驗驗證研究。重點(diǎn)介紹了基于結構/配體的虛擬篩選方法、成藥性理論預測和分子靶標識別展開(kāi)了系統和深入的方法學(xué)研究,并把發(fā)展的方法與實(shí)驗平臺無(wú)縫銜接用于多個(gè)重要靶點(diǎn)的藥物分子設計和生物活性分子的作用靶標識別。

陳海峰教授報告了課題組通過(guò)矯正八個(gè)無(wú)規傾向性的氨基酸、二十種氨基酸、八十種氨基酸環(huán)境的CMAP參數,發(fā)展了ff99IDPs,ff14IDPs,ff14IDPSFF, ff03CMAP, ESFF1等系列精準的無(wú)規蛋白分子力場(chǎng),新力場(chǎng)能重現天然無(wú)規蛋白的構象特征,并準確預測天然無(wú)規蛋白的化學(xué)位移、J-Coupling、NOE等參數。與現有分子力場(chǎng)相比,精準力場(chǎng)對天然無(wú)規蛋白的模擬更加精確而且更加高效。

報告最后,三位教授就師生們的相關(guān)問(wèn)題進(jìn)行了細致解答,使得師生們對報告內容有了更深入的理解。本次學(xué)術(shù)報告開(kāi)闊了化工學(xué)院在化學(xué)信息學(xué)和生物信息學(xué)方面的科學(xué)視野,促進(jìn)了師生在相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)交流。

新聞小貼士:

張增輝,華東師范大學(xué)教授,上海紐約大學(xué)計算化學(xué)聯(lián)合研究中心主任, 深圳理工大學(xué)合成學(xué)院講席教授。在國際核心學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表論文400余篇,論文引用13,000余次,H-index指數60 (web of science),目前擔任Phys. Chem. Chem. Phys. 的副編輯。

曹東升,中南大學(xué)湘雅藥學(xué)院教授。發(fā)表SCI論文100余篇,開(kāi)發(fā)軟件平臺35套,獲軟件著(zhù)作權22項, 累計訪(fǎng)問(wèn)540萬(wàn)余次;申請中國專(zhuān)利13項,參編英文專(zhuān)著(zhù)一部。獲得國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金面上項目、湖南省重點(diǎn)研發(fā)計劃、湖南省杰出青年基金等國家、省部級和橫向科研項目20余項,累計經(jīng)費1500余萬(wàn)?,F任湖南省生物醫學(xué)信息委員會(huì )副主任委員,中國計算機化學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì )委員,中國計算毒理學(xué)專(zhuān)業(yè)委員會(huì )委員。受邀擔任SCI期刊CMES-Comp. Model. Eng.副主編和Chemometr. Intell. Lab.編委。

陳海峰,上海交通大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院微生物代謝國家重點(diǎn)實(shí)驗室教授,博士生導師,生物信息學(xué)與生物統計學(xué)系副系主任。Chemical Biology &Drug Design雜志副主編。上海市浦江人才。主要從事天然無(wú)規蛋白的精準分子力場(chǎng)、計算合成生物學(xué)以及計算機輔助創(chuàng )新藥物發(fā)現等研究。迄今為止已在JACS, PNAS, NAR,Bioinformatics,JCTC等國際著(zhù)名學(xué)術(shù)期刊發(fā)表了130多篇SCI論文。文章引用超過(guò)2500次。H因子為28。獲上海市科技進(jìn)步一等獎。主持五項國家自然科學(xué)基金面上項目, 參與三項國家重點(diǎn)研發(fā)計劃子課題。

(核稿:仝建波 編輯:郭姍姍)

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